神遗大战后，侵袭人间的魔物们被赶回魔界，无涯魔王被诸神以黄道十二宫星座的力量封印于大陆之东。

“——吾以魔魂起誓，吾重见天日之时，便是愚蠢的人类与傲慢的诸神灭亡之日！”封印闭合之际，魔王的怒吼响彻天地。

诸神担忧魔王誓言成真，以神力助全天八十八星座化为星灵，在大陆之东守护封印。千年时光倏忽而过，封印之地上建起一座小镇，星灵们化身为星之咲学园的学生们，与小镇的居民一同生活和守护着这里。

封印的力量随着时光流逝渐渐削弱，魔界的上位支配者苏醒，开始谋划着冲破封印解放魔王。小镇上不断出现魔界裂缝，魔物们汹涌而出。星灵们以黄道十二宫为首组成十二支战队，划定各自的负责范围，每日巡逻并消灭出现的魔物。然而，经年累月的时光洗礼，没有诸神神力加持，星灵们的力量渐渐减弱，不仅要镇压封印中魔王的冲击，还要应对来自魔界诸多魔物的袭击。代代负责统率星灵的仙王座深感危机逼近，恰于此时，一直保存于月读教堂的古老典籍《星图史典》的守护精灵萤自长眠中苏醒，而长年在星相馆观星的天秤座也得到了来自诸神的神谕——寻找星灵使，方可度过此次危机。

主人公作为“诸神的眷顾者”，成为被众人寄予厚望的星灵使。在听从仙王座的安排转学到了星之咲学园后，虽然对“守护封印”“拯救世界”什么的没什么兴趣，主人公在与星灵们朝夕相处的时间里，渐渐地与这些不同性格的可爱人们成为了朋友。

就在他以为日子就要在这种“日常打小怪”的悠闲中度过时，某一天，一路引导他成为星灵使的萤失踪了。紧接着魔界之门大开，大量的魔物出现，学园里硝烟四起，星灵们疲于应对，甚至有普通的学生伤亡。而这时，萤和魔界的上位支配者幽姬一同出现在他面前——“这种半调子的觉悟，还妄想拯救世界，可笑！”

一直照顾他的由依酱为他挡开了致命攻击，主人公无助地看着魔物蹂躏无辜的学生，萤那句冰冷无情的话语一直在耳边回响，幽姬的第二次攻击近在眼前，死亡的气息第一次如此迫近……

就在这时，主人公蓦然惊醒，眼前是由依酱亲切的笑脸——之前发生的种种到底是真？是梦？是预知了必然的未来？还是只是一个悠长的噩梦？

 “拯救世界什么的我确实不感兴趣，”主人公眼神坚毅，“但保护朋友的心意，才不是半调子！”